Additional Information

Field Value
Data last updated April 22, 2026
Metadata last updated April 22, 2026
Created April 22, 2026
Format json
License No License Provided
Resource type distribution
Access rights
Applicable legislation
Conforms to
Contact point
Description Duomenų rinkinys iš Nacionalinės visuomenės sveikatos laboratorijos, sekoskaitos tyrimų duomenų bazės apie SARS-CoV-2 atliktus testų ir sekoskaitos rezultatus. Duomenų rinkinį sudaro trys lentelės: 1. Žmonėms atlikti SARS-CoV-2 PGR ir antigeno testai; 2. SARS-CoV-2 sekoskaitos Nextclade rezultatų ataskaita; 3. SARS-CoV-2 sekoskaitos Pangolin rezultatų ataskaita. Duomenų teikėjas – Nacionalinė visuomenės sveikatos priežiūros laboratorija. Duomenys kaupiami nuo 2022 m. lapkričio 1 d. Su duomenimis susijusiais klausimais prašome kreiptis el. paštu atverimas@stat.gov.lt . Dėl techninių portalo veiklos sutrikimų prašome kreiptis el. paštu atviriduomenys@vssa.lt . antigenai nacionalinė visuomenės sveikatos laboratorija rezultatai sekoskaita
Documentation
Endpoint description
Endpoint URL
Keywords
Landing page
License Creative Commons Attribution 4.0 International
Publisher
Serves dataset
Theme
    Title SARS-CoV-2 viruso sekoskaitos duomenys
    First field TDS000001
    Access URL
    1. https://data-api.testdataportal.gov.lt/namespaces/195551983/tables/pangolin_ataskaita/query
    Availability
    Byte size
    Checksum
    Compression format json
    Download URL
    Has policy
    Language Lithuanian
    Linked schemas
    Media type json
    Modification date March 26, 2026
    Packaging format
    Release date March 26, 2026
    Rights
    Spatial resolution
    Status Completed
    Temporal resolution
    Table schema {"schema_type": "csvw", "tableSchema": {"columns": [{"name": "meg_id", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Mėginio identifikacinis numeris"}}, {"name": "linija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Pango priskirta COVID viruso linija"}}, {"name": "scorpio_konst_gr", "datatype": "string", "titles": {"lt": "SCORPIO konsteliacijos grupė"}, "description": "SCORPIO programinės įrangos priskirta mutacijų konsteliacijos grupė"}, {"name": "pango_kolizija", "datatype": "number", "titles": {"lt": "Pango kolizija"}, "description": "\"Nurodoma kiek kitų linijų gali būti priskirta pagal pangoLEARN modelį. Jei vertė 0, tuomet jokios kitos linijos neatitinka dabartinės sekos, jei didesnis nei 0, tuomet nurodoma kiek linijų atitinka nusekvenuotą seką.\""}, {"name": "scorpio_patik_balas", "datatype": "number", "titles": {"lt": "SCORPIO patikimumo balas"}, "description": "\"Patikimumo balas (angl. support score), kuris nurodo proporciją alternatyvių alelių genų sekoje\""}, {"name": "scorpio_kolizijos_ivert", "datatype": "number", "titles": {"lt": "SCORPIO kolizijos įvertis"}, "description": "\"Kolizijos įvertis (angl. confict score) yra proporcija apibrėžtų variantų, kurie turi referencinius alelius sekoje. Dviprasmiškos/kitos ne referencinės/alternatyvios bazės kiekvieno varianto pozicijoje prisideda prie šio įverčio denominatoriaus.\""}, {"name": "scorpio_pastabos", "datatype": "string", "titles": {"lt": "SCORPIO pastabos"}, "description": "SCORPIO programinės įrangos pastabų stulpelis"}, {"name": "scorpio_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "SCORPIO versija"}}, {"name": "pangolin_modelio_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Pangolin modelio versija"}, "description": "\"Pangolin versijos ir modeliai, kurie naudojami sekų klasifikavimui\""}, {"name": "pangolin_duomenu_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Pangolin duomenų versija"}}, {"name": "konsteliacijos_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Mutacijų konsteliacijos versija"}}, {"name": "ar_linija_priskira", "datatype": "boolean", "titles": {"lt": "Ar linija priskirta"}, "description": "Nurodoma ar atitinkama seka turi oficialiai priskirtą liniją"}, {"name": "kokybe", "datatype": "string", "description": "\"Statusas, nurodantis, ar sekos kokybė yra tinkama\""}, {"name": "kokybes_pastabos", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Kokybės kontrolės pastabos"}}, {"name": "bendros_pastabos", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Bendros pastabos"}, "description": "\"Pastabų laukas, kuris aprašo problemas susijusias su sprendimų schemomis (angl. decision tree). Jei sekoskaitos kokybės kontrolė netinkama, šiame stulpelyje nurodoma priežastis. Jei seka atitinka VNP slenkstį, kad Scorpio nustatytų mutacijų konsteliaciją, čia bus nurodomas konkretus VNP, alternatyvių ir dviprasmiškų alelių skaičius.\""}]}}
    Identifier tod000355
    Other identifier
    1. p
    2. a
    3. n
    4. g
    5. o
    6. l
    7. i
    8. n
    9. _
    10. a
    11. t
    12. a
    13. s
    14. k
    15. a
    16. i
    17. t
    18. a
    Access url['https://data-api.testdataportal.gov.lt/namespaces/195551983/tables/pangolin_ataskaita/query']
    Access serviceTDS000001
    Compression formatjson
    Datastore activeFalse
    Datastore contains all records of source fileFalse
    Description translated{'lt': 'Duomenų rinkinys iš Nacionalinės visuomenės sveikatos laboratorijos, sekoskaitos tyrimų duomenų bazės apie SARS-CoV-2 atliktus testų ir sekoskaitos rezultatus. Duomenų rinkinį sudaro trys lentelės: 1. Žmonėms atlikti SARS-CoV-2 PGR ir antigeno testai; 2. SARS-CoV-2 sekoskaitos Nextclade rezultatų ataskaita; 3. SARS-CoV-2 sekoskaitos Pangolin rezultatų ataskaita. Duomenų teikėjas – Nacionalinė visuomenės sveikatos priežiūros laboratorija. Duomenys kaupiami nuo 2022 m. lapkričio 1 d. Su duomenimis susijusiais klausimais prašome kreiptis el. paštu atverimas@stat.gov.lt . Dėl techninių portalo veiklos sutrikimų prašome kreiptis el. paštu atviriduomenys@vssa.lt . antigenai nacionalinė visuomenės sveikatos laboratorija rezultatai sekoskaita', 'en': 'Duomenų rinkinys iš Nacionalinės visuomenės sveikatos laboratorijos, sekoskaitos tyrimų duomenų bazės apie SARS-CoV-2 atliktus testų ir sekoskaitos rezultatus. Duomenų rinkinį sudaro trys lentelės: 1. Žmonėms atlikti SARS-CoV-2 PGR ir antigeno testai; 2. SARS-CoV-2 sekoskaitos Nextclade rezultatų ataskaita; 3. SARS-CoV-2 sekoskaitos Pangolin rezultatų ataskaita. Duomenų teikėjas – Nacionalinė visuomenės sveikatos priežiūros laboratorija. Duomenys kaupiami nuo 2022 m. lapkričio 1 d. Su duomenimis susijusiais klausimais prašome kreiptis el. paštu atverimas@stat.gov.lt . Dėl techninių portalo veiklos sutrikimų prašome kreiptis el. paštu atviriduomenys@vssa.lt . antigenai nacionalinė visuomenės sveikatos laboratorija rezultatai sekoskaita'}
    Has viewsFalse
    Idtod000355
    Identifiertod000355
    Language['lit']
    Licencecc_by_4_0
    Media typejson
    Modification date2026-03-26
    Other identifierpangolin_ataskaita
    Package idd000781
    Position0
    Release date2026-03-26
    Resource typedistribution
    Stateactive
    Statuscompleted
    Table schema{"schema_type": "csvw", "tableSchema": {"columns": [{"name": "meg_id", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Mėginio identifikacinis numeris"}}, {"name": "linija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Pango priskirta COVID viruso linija"}}, {"name": "scorpio_konst_gr", "datatype": "string", "titles": {"lt": "SCORPIO konsteliacijos grupė"}, "description": "SCORPIO programinės įrangos priskirta mutacijų konsteliacijos grupė"}, {"name": "pango_kolizija", "datatype": "number", "titles": {"lt": "Pango kolizija"}, "description": "\"Nurodoma kiek kitų linijų gali būti priskirta pagal pangoLEARN modelį. Jei vertė 0, tuomet jokios kitos linijos neatitinka dabartinės sekos, jei didesnis nei 0, tuomet nurodoma kiek linijų atitinka nusekvenuotą seką.\""}, {"name": "scorpio_patik_balas", "datatype": "number", "titles": {"lt": "SCORPIO patikimumo balas"}, "description": "\"Patikimumo balas (angl. support score), kuris nurodo proporciją alternatyvių alelių genų sekoje\""}, {"name": "scorpio_kolizijos_ivert", "datatype": "number", "titles": {"lt": "SCORPIO kolizijos įvertis"}, "description": "\"Kolizijos įvertis (angl. confict score) yra proporcija apibrėžtų variantų, kurie turi referencinius alelius sekoje. Dviprasmiškos/kitos ne referencinės/alternatyvios bazės kiekvieno varianto pozicijoje prisideda prie šio įverčio denominatoriaus.\""}, {"name": "scorpio_pastabos", "datatype": "string", "titles": {"lt": "SCORPIO pastabos"}, "description": "SCORPIO programinės įrangos pastabų stulpelis"}, {"name": "scorpio_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "SCORPIO versija"}}, {"name": "pangolin_modelio_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Pangolin modelio versija"}, "description": "\"Pangolin versijos ir modeliai, kurie naudojami sekų klasifikavimui\""}, {"name": "pangolin_duomenu_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Pangolin duomenų versija"}}, {"name": "konsteliacijos_versija", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Mutacijų konsteliacijos versija"}}, {"name": "ar_linija_priskira", "datatype": "boolean", "titles": {"lt": "Ar linija priskirta"}, "description": "Nurodoma ar atitinkama seka turi oficialiai priskirtą liniją"}, {"name": "kokybe", "datatype": "string", "description": "\"Statusas, nurodantis, ar sekos kokybė yra tinkama\""}, {"name": "kokybes_pastabos", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Kokybės kontrolės pastabos"}}, {"name": "bendros_pastabos", "datatype": "string", "titles": {"lt": "Bendros pastabos"}, "description": "\"Pastabų laukas, kuris aprašo problemas susijusias su sprendimų schemomis (angl. decision tree). Jei sekoskaitos kokybės kontrolė netinkama, šiame stulpelyje nurodoma priežastis. Jei seka atitinka VNP slenkstį, kad Scorpio nustatytų mutacijų konsteliaciją, čia bus nurodomas konkretus VNP, alternatyvių ir dviprasmiškų alelių skaičius.\""}]}}
    Title translated{'lt': 'SARS-CoV-2 viruso sekoskaitos duomenys', 'en': 'SARS-CoV-2 viruso sekoskaitos duomenys'}